В соответствии с п.7 ч.1 § 13 Закона о гигиене и безопасности труда (Töötervishoiu ja tööohutuse seadus) работодатель обязан организовать обследование состояния здоровья тем работникам, на здоровье которых в процессе труда могут повлиять факторы опасности производственной среды или специфика труда, а также нести связанные с этим расходы. Обычно основанием для обследования состояния здоровья является анализ рисков в производственной среде. На самом деле таких рабочих мет, на которых не было бы факторов опасности, могущих неблагоприятно повлиять на работника, очень мало.  Поэтому подразумевается, что для большинства работников работодатель должен организовать обследование состояния здоровья.

В соответствии с ч.2 § 5 постановления «Порядок обследования состояния здоровья работников» обследование состояния здоровья работников должно начинаться с первичного обследования в первый месяц  поступления работника на работу, а в случае с работающими в ночное время – до поступления их на работу (п. 71 ч.1 § 13 Закона о гигиене и безопасности труда).

Обследование состояния здоровья у врача по гигиене труда не должно сводится к исполнению закона – напротив, оно должно осуществляться с индивидуальным подходом, обеспечивая соответствие работника рабочему месту и позволяя рано выявить нарушения здоровья, вызванные работой. Так, работника, постоянно трудящимся в рабочей среде с высокой концентрацией мучной пыли, рекомендуется в ходе обследования состояния здоровья сделать тест на аллергию или исследование функции легких, чтобы предотвратить возникновение заболеваний, обусловленных аллергией на мучную пыль. Работающим в ночное время в ходе обследования состояния здоровья необходимо сделать электрокардиограмму, которая поможет оценить риск возможных сердечных заболеваний. Таким образом, исследования, проводимые в рамках обследования состояния здоровья, должны быть тесно связаны с факторами риска, наличествующими в производственной среде.