При оценке налогообложения дохода, полученного от продажи квартиры, существенным обстоятельством является то, использовал ли собственник квартиру до отчуждения в качестве своего места жительства или нет. Подоходным налогом не облагается доход, полученный от продажи жилого помещения, если собственник использовал квартиру до ее отчуждения в качестве своего места жительства и если он не продавал в течение двух лет жилое помещение, к доходу от продажи которого применялось освобождение от налога (п. 1 ч. 5 и ч. 6 § 15 TuMS).

Таким образом, для применения освобождения от подоходного налога существуют  два условия:

• использование помещения до продажи в качестве своего места жительства
• неприменение в течение двух лет освобождения от налога

Вы отметили, что непосредственно перед продажей квартиры вы жили в ней 2-3 месяца и что проданная квартира была отмечена в регистре народонаселения в качестве вашего места жительства. Если вы в течение двух лет не продавали жилого помещения, то доход, полученный вами от продажи этой квартиры, не будет облагаться подоходным налогом.
Следует учесть, что если одновременно с использованием квартиры в качестве жилого помещения вы использовали ее также в иных целях (например, сдавали комнату внаем), то освобождение от налога применяется только к той части квартиры, которую вы использовали как жилое помещение.
Законом не установлен список доказательств, с помощью которых  лицо должно/может подтвердить использование квартиры в качестве места жительства. Наличие прописки не имеет решающего значения. Использование в качестве места жительства определяется связанностью квартиры с личными и экономическими  интересами налогоплательщика. На практике налоговый управляющий для получения подтверждения тому, жил ли человек в квартире или нет, опрашивал соседей, анализировал потребление воды и электроэнергии, высланные квартирному товариществу извещения, использование налогоплательщиком банковской карточки (в каком районе ее использовали) и так далее.   По отдельности все перечисленные выше данные  не могут быть достаточным доказательством использования жилого помещения, но в совокупности могут внести ясность в вопрос, использовал ли человек, и если использовал, то как,  данную квартиру.