В соответствии с регулирующей продажу квот директивой Европейского союза и Законом о защите атмосферного воздуха, общие цели, которые должны быть достигнуты за счет использования не менее половины выручки от аукциона, направлены на смягчение последствий изменения климата и адаптацию к нему.
В том числе это, например, развитие энергоэффективности, связывание углерода в лесном хозяйстве, поощрение внедрения менее загрязняющих видов транспорта и тому подобное. Исходя из международного сотрудничества в области климата, Эстония часть выручки от продаж с аукциона направляет на поддержку достижения климатических целей развивающимися странами.
Распределение поступающих в госбюджет денег регулируется стратегией госбюджета. За внедрение согласованных мер отвечают Министерство окружающей среды, Министерство экономики и коммуникаций и Министерство финансов.