Согласно постановлению совета ЕС, совокупный объем квот Эстонии по салаке на 2011 год составляет 28.877 тонн, из которых в Рижском заливе допускается промысел 16.809 тонн. В центральной части Балтики квота на промысел салаки по сравнению с прошлым годом сокращается на 2130 тонн, для Рижского залива остается прежней. Совокупная квота на лов кильки составляет 33.077 тонн, в прошлом году она составляла 43.522 тонны. Общая квота на промысел трески составляет 1502 тонн, из которых в восточной части Балтики допускается добыча 1320 тонн, в западной части моря - 182 тонн. По сравнению с 2010 годом квота на промысел трески увеличена на 183 тонны.
Постановление также фиксирует допустимые, не регулируемые международными организациями и ЕС квоты лова траулерами за пределами Балтики, они остаются на уровне прошлогодних.
Лосося эстонские рыбаки могут добыть в Финском заливе 1581 особь, в открытой части Балтики - 5267 особей.
Квоты рыбопромысла в озерах Чудском, Псковском и Теплом устанавливаются на основании эстонско-российских договоренностей. Для Эстонии на этих озерах увеличены квоты добычи судака, леща, окуня и щуки, снижена квота на плотву, поскольку в 2010 году она была обменена на квоту по окуню, что теперь высчитывается из квоты следующего года.
BNS