Объем экспорта в текущих ценах из Эстонии составил в 2013 году 12,3 млрд евро, объем импорта в Эстонию - 13,7 млрд евро. Дефицит товарообмена составлял в 2013 году 1,4 млрд евро, в 2012 году - 1,3 млрд евро, наиболее крупный профицит наблюдается в товарообмене со Швецией и Россией, наиболее крупный дефицит - с Германией и Литвой.
Главными целевыми государствами направлений экспорта из Эстонии в 2013 году были Швеция, Финляндия и Россия, куда направлялось соответственно 17%, 16% и 11% всего эстонского экспорта, в первую тройку государств с наиболее значительными объемами импорта в Эстонию вошли Финляндия, Германия и Швеция - соответственно 15%, 11% и 10% годового импорта в Эстонию. В 2013 году больше всего из Эстонии экспортировалось электрооборудования, которое составило 20% экспорта из Эстонии, а также минеральная продукция, в том числе бензин, сланец, электроэнергия (11% экспорта) и сельхозпродукция и продукты питания ( 10% экспорта).